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《生物技术设计工具》(ReCore v1.8.14)[光盘镜像]

  • 状态: 精华资源
  • 摘要:
    发行时间2009年
    制作发行biosolveit
    语言英文
  • 时间: 2009/03/04 08:32:22 发布 | 2009/03/04 10:38:50 更新
  • 分类: 软件  行业软件 

恩瑶

精华资源: 268

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中文名生物技术设计工具
英文名ReCore v1.8.14
资源格式光盘镜像
发行时间2009年
制作发行biosolveit
地区美国
语言英文
简介

IPB Image
语言:英语
网址:http://www.biosolveit.de/ReCore/
类别:生物技术设计工具

与传统药物化学致力于产生活性化合物的类似物的策略不同,核心迁越通过保留一个潜在的先导化合物的活性,搜索新的骨架。这个策略中使用的计算工具的目标是与结合相关的性质,而不是与化学结构相关的性质。

基于片段的设计策略可以被用来对骨架迁越提供支持。BioSolveIT 公司CEO Christian Lemmen说,利用计算机的配基设计的主要困难是“能否对结合亲和性进行准确预测的问题以及检测低亲和性结合物的能力的问题,这些问题在对于片段的情况下是经常出现的。”他解释到,BioSolveIT的ReCore是一个基于配基的设计工具,“这个工具通过仅仅选取连接核心片段与其R-基团的向量进行配基结构的提取。”

如其名字所寓意的,ReCore定位并去除分子的核心,并且在3D-片段库中寻找合适的替代核心,形成一个新的骨架。在这个过程中保持周围的部件不变以产生一个化学上不同的查询化合物。ReCore是Patrick Maass在汉堡大学的生物信息学中心与.罗氏公司合作开发的。这个软件的开发人员最近把它应用在基于小分子晶体结构构象的骨架迁越上(J. Chem. Inf. Model. 2007; doi: 10.1021/ci060094h)。

安装说明
安装后将patch复制到安装目录 \Recore\recore\下。

引用
Unrar, Mount/Burn, Install.
Put the patch in the <install dir>\Recore\recore\ and run it.

Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
some time, but the main exe is not beta.

nethero@TLF-ED => 806.2MB
NFO:
代码

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            ▀▀▀          Nearing the edge of the galaxy

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                         ReCore v1.8.14 (c) BioSolveIT

                              Type ..... : Molecular
                              Date ..... : 03/2009
                              Size ..... : 57x15MB
                              OS ....... : Windows
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   ░▓█████████████████████▓░  [ RELEASE NOTES  ]  ░▓██████████████████████▓░
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   ReCore is a computer program for scaffold hopping and core replacement:
   You have a 3D structure of a ligand. ReCore can replace an unwanted part
   (defined by bond cuts) so that the new part respects the dangling bonds
   as good as possible. Additionally, user-defined "pharmacophore features"
   can be employed to direct the search.

   A typical workflow is a two stage process, of which Stage A needs to be
   performed only once:

   Stage A: Shredding of libraries and creation of an index for fast search
   Stage B: Searching the fragment library using a query and the database
   exploiting the index.

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   ░▓█████████████████████▓░  [  INSTALLATION  ]  ░▓██████████████████████▓░
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   Unrar, Mount/Burn, Install.
   Put the patch in the <install dir>\Recore\recore\ and run it.

   Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
         some time, but the main exe is not beta.

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   ░▓████████████▓░    [ Nearing the edge of the galaxy ]   ░▓████████████▓░
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   This is for evaluation purposes. If your like the software, go buy it.

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    小贴士:
  1. 类似“顶”、“沙发”之类没有营养的文字,对勤劳贡献的楼主来说是令人沮丧的反馈信息。
  2. 提问之前请再仔细看一遍楼主的说明,或许是您遗漏了。
  3. 勿催片。请相信驴友们对分享是富有激情的,如果确有更新版本,您一定能搜索到。
  4. 请勿到处挖坑绊人、招贴广告。既占空间让人厌烦,又没人会搭理,于人于己都无利。
  5. 如果您发现自己的评论不见了,请参考以上4条。